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卧龙国家自然保护区
四川卧龙国家级自然保护区，创建于1963年，当时面积2万公顷，1975年，面积扩大到20万公顷，是我国建立最早、栖息地面积最大、以保护大熊猫及高山森林生态系统为主的综合性自然保护区，是2006年7月世界遗产大会批准列入世界自然遗产名录的“卧龙·四姑娘山·夹金山脉”四川大熊猫栖息地最重要的核心保护区。卧龙自然保护区以“熊猫之乡”、“宝贵的生物基因库”、“天然动植物园”享誉中外。
卧龙自然保护区地理条件独特、地貌类型复杂，风景秀丽、景观多样、气候宜人，集山、水、林、洞、险、峻、奇、秀于一体，还有浓郁的藏、羌民族文化。区内建有相当规模的大熊猫、小熊猫、金丝猴等国家保护动物繁殖场;有世界著名的“五一棚”大熊猫野外观测站;有国内迄今为止以单一生物物种为主建立的博物馆的大熊猫博物馆。


蜂桶寨自然保护区
蜂桶寨自然保护区位于四川省宝兴县东北部，地处邛崃山西坡。1975年建立，面积39039公顷。主要保护对象珍稀濒危动物大熊猫、金丝猴及山地混合森林生态系统。保护区位于夹金山下。面积4万公顷，群山连绵，河谷纵横，箭竹茂密，有珍稀动物378种，维管束植物1050种。保护区是是大熊猫的发现地。1869年法国传教士兼生物学家戴维在邓池沟首次发现大熊猫，使动物活化石大熊猫享誉世界。
保护区是大熊猫、金丝猴等标本的采集地。1869年从宝兴采到金丝猴标本，引起了世界生物学界的巨大兴趣。从此，宝兴被誉为“采集圣地”。解放后从宝兴捕获作为“国礼”送往国外的大熊猫有80多只，国内还有20多只。保护区国家保护动物一级有大熊猫、扭角羚、白唇鹿、白臀鹿、川金丝猴、雪豹、绿尾虹雉、斑尾榛鸡等;二级有猕猴、短尾猴、小熊猫、金猫、猞猁、马麝、水鹿、大灵猫、小灵猫、斑羚、岩羊、红腹角雉、藏马鸡、血雉、红腹锦鸡、大鲵等。保护区可以作为遗传资源的原地保护点。

四姑娘山国家级自然保护区
四姑娘山国家级自然保护区地处横断山脉北段向四川盆地过渡的边缘地带，属典型的高山峡谷地貌，最高峰四姑娘山海拔6250米，绝对高度和相对高差很大,这里有高原特有的洁净蓝天，皑皑白雪，并与奇峰异树、飞瀑流泉、草甸溪流交融成一幅奇异景观。其中四姑娘山双桥沟纵深30余公里，峡谷时宽时窄，宽阔处可达数公里，斜坡上覆以广阔的草坪，溪流蜿蜒其间，两岸沙?树丛生宛似一条绿色长龙绵延长达数公里。而每当金秋，四姑娘山树叶转红，又是一番景色。位于长坪及海子两沟深处的四姑娘山，海拔6250米，终年积雪，直插蓝天，蔚为壮观。
区内生态条件复杂多样，生物群落类型多样，植被垂直带谱明显，物种丰富，其植物区系成分以喜马拉雅成分占优势，为横断山脉地区最好的代表。据初步调查，高等植物有150多科520属1500余种，珍稀特有种较多，列为国家重点保护的珍稀濒危植物有独叶草、星叶草、桃儿七等10余种。本区又是典型的高山草甸动物类群分布区，动物种类丰富，垂直分异十分明显，已发现的脊椎动物54科270多种，其中列为国家重点保护的野生动物有牛羚、金丝猴、白唇鹿、雪豹、绿尾虹雉、小熊猫等28种。该保护区的建立，对保护中国西部地区的生物多样性和景观多样性，研究我国特有珍稀动植物种群的进化分类与繁殖等方面都有着重要的意义。同时，本区冰川、高山湖泊、瀑布与原始植被构成优美的自然景观，因而也是游览的胜地。